De beslissing tot sluiting van de Stormvloedkering wordt niet door mensen, maar door de computer genomen. Daartoe is een zeer geavanceerd computerprogramma ontwikkeld, het Beslis en Ondersteunend Systeem (BOS). Dit systeem verwerkt diverse data, iedere tien minuten opnieuw, 24 uur per dag, met onder meer meetgegevens over wind en water, weersverwachting en getij. Deze gegevens worden omgerekend tot verwachte waterstanden voor Dordrecht, Rotterdam en Spijkenisse.

Wanneer het computersysteem BOS een stormvloed ziet aankomen, worden automatisch twee bedieningsploegen van tien man opgeroepen. De feitelijke bediening gebeurt door het Besturingssysteem (BES).

Het overdragen van de commando's aan een computerprogramma is onderwerp geweest van uitvoerige discussie. Hiertoe is besloten na onderzoek aan de Rijksuniversiteit Leiden, waarbij is vastgesteld dat de mens in 1 op de 1.000 gevallen een foute beslissing zou nemen over het sluiten of juist openlaten van de Stormvloedkering, terwijl het ontwikkelde computerprogramma BOS een "faalkans" wordt toegerekend van 1 op 100.000 beslissingen. Bedieningspersoneel zal slechts eenmaal per jaar - bij een proefsluiting - de kering in werking kunnen stellen. Overigens zal het personeel niet kunnen ingrijpen, ook niet wanneer de computer ten onrechte het commando geeft de kering te sluiten.