Op 14 januari 1999 heeft het Europees Parlement een resolutie aangenomen over de verbetering van het financieel beheer van de Europese Commissie, waarin inter alia wordt verlangd dat "onder auspiciën van het Parlement en de Commissie een commissie van onafhankelijke deskundigen wordt ingesteld" (B4-0065, 0109 en 0110/99).

Op 27 januari 1999 heeft de Conferentie van voorzitters van het Europees Parlement een "nota over het Comité van onafhankelijke deskundigen" behandeld en goedgekeurd, waarbij de samenstelling en onderzoeksopdracht van dit Comité zijn vastgesteld.

Op dezelfde vergadering heeft de voorzitter van de Commissie zich akkoord verklaard met de samenstelling en onderzoeksopdracht van het Comité van onafhankelijke deskundigen.

In een brief d.d. 1 februari 1999 aan de voorzitter van het Europees Parlement heeft de voorzitter van de Commissie bevestigd dat de Commissie akkoord gaat met de samenstelling en onderzoeksopdracht van het Comité van onafhankelijke deskundigen.

Op 2 februari 1999 heeft het Comité van onafhankelijke deskundigen zijn eerste bijeenkomst gehouden en de heer André MIDDELHOEK tot voorzitter benoemd.

Op 15 maart 1999 heeft het Comité zijn eerste rapport voorgelegd aan de voorzitter van het Europees Parlement en de voorzitter van de EG-Commissie.