NIEUWSSELECTIE
KORT NIEUWS
RADIO & TELEVISIE
MEDIA
|
Gebruikersvriendelijke genen
Twee versies van de DNA-
volgorde van de mens werden afgelopen maandag naar buiten gebracht: een
door het Britse wetenschappelijke tijdschrift Nature, de ander
door het Amerikaanse blad Science.
Het lijkt een fotofinish maar de twee versies lopen in kwaliteit flink uiteen. De compleetste en
nauwkeurigste versie, in Science, werd geconstrueerd door
onderzoekers gelieerd aan het bedrijf Celera Genomics. Dat die versie
beter is dan die van de publiek gefinancierde Humaan Genoom
Organisatie, is geen wonder: Celera hield tot nu toe haar gegevens
geheim om concurrenten niet in de kaart te spelen. Omdat het 'publieke'
project haar ruwe gegevens steeds direct op internet publiceerde,
beschikte Celera feitelijk over een dubbele gegevensset. De code van
Celera mist nog negen procent van de naar schatting 2,9 miljard basen
omvattende erfelijke code. Wat er wel is, is voor 99,94 procent correct,
bijna genoeg voor de gouden standaard van 99,99 procent. Maar de code
van Celera is niet gratis op grote schaal in te zien, tenzij het
instituut van een onderzoeker schriftelijk verklaart nooit geld aan de
kennis te zullen verdienen. Hoeveel instituutsdirecteuren zo'n
verklaring zullen tekenen, is zeer de vraag. Aan publieke zijde
ontbreekt nog maar zeven procent van de basevolgorde en voldoet 30
procent aan de hoogste kwaliteitseisen. De andere tweederde is echter
een rommeltje. "Toen we vorige week in de publieke databank keken,
troffen we op een bepaalde plek twee genen aan", zegt prof.dr. Han
Brunner. "Maar toen we gisteren weer keken, was een stuk omgedraaid en
bleek het opeens om één gen te gaan. In de publieke
gegevens gebeurt dit soort dingen nog voortdurend. Er zitten grote
gaten in, en veel stukken zijn ongesorteerd. Dat maakt de code in de
praktijk moeilijk bruikbaar." Onderzoekers als prof.dr. Gert Jan van
Ommen vinden dan ook dat Nederlandse genetici zo snel mogelijk een
betaald abonnement moeten hebben op de gegevens van Celera. Niet alleen
is die code betrouwbaarder, het bedrijf levert ook
gebruikersvriendelijker programmatuur om de code te analyseren. Toegang
tot www.celera.com, meent Van Ommen, is cruciaal voor onderzoekers die
altijd de eerste moeten zijn: "In de wetenschap worden nu eenmaal geen
zilveren medailles uitgereikt." Van Ommen wordt op zijn wenken bediend.
Namens Nederland onderhandelt de Nederlandse Organisatie voor
Wetenschappelijk Onderzoek ( NWO) met Celera. Hoewel over kleine
lettertjes nog wordt gepraat, en geen van beide partijen zonder akkoord
veel kwijt wil, blijkt onder andere uit berichten in het weekblad
Science dat de kosten minder hoog zijn dan ooit verwacht: 45.000
dollar, ofwel ruim 100.000 gulden, voor een contract van drie jaar.
Naar verluidt zal NWO daarvan de helft voor zijn rekening willen
nemen. Voor genetische labs is een abonnement een zinnige investering,
meent Brunner: "Voor zo'n bedrag stel ik anders een halve analist aan.
Maar als ik in plaats van geploeter in het laboratorium met
één internet-aansluiting twee erfelijke ziekten oplos,
dan is het geld goed besteed." Over drie jaar, hoopt prof.dr. Ronald
Plasterk, kan het contract worden opgezegd. "Dan beschikt ook het
publieke project over betrouwbare gegevens, die dan voor iedereen
gratis toegankelijk zijn. En na het maken van handige software zie ik
niet in waarom met de Celeragegevens dingen kunnen die elders
onmogelijk zijn."
|
NRC Webpagina's
17 FEBRUARI 2001
Archief Wetenschap & Onderwijs
|